Margulis describe a los organismos del phylum Rhizopoda como amebas poseedoras de mitocondrias y carentes de undulipodia a lo largo de todo su ciclo de vida. Se distinguen dos clases: Lobosea y Acrasiomycota.
Losboea se encuentra tanto en agua dulce como en agua marina y es común en los suelos. Se trata de organismos unicelulares. Carecen de meiosos y no se reproducen sexualmente sino mediante la división directa de la célula madre en dos células hijas de igual tamaño.