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Género Pseudomonas
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* Especies cuya clasificación está en duda. P. syzygii y P. rubrisubalbicans comparten una alto nivel de homología en su rRNA con las especies de Burkholderia y es posible que pertenezcan a dicho género.
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Género Burkholderia
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El género Burkholderia agrupa especies antiguamente clasificadas dentro del género Pseudomonas pero que han sido separadas de ellas por el hecho de presentar diferencias en sus secuencias de rRNA.